Modelli
Molecolari
Gli strumenti informatici, capaci di visualizzare le molecole in tre dimensioni, costituiscono un prezioso aiuto per capire la disposizione spaziale degli atomi costituenti una molecola.
Tra i numerosi programmi di visualizzazione molecolare per PC, reperibili in rete, viene qui proposto RASMOL (versione 2.6-b 2), un applicativo per Windows 95/98 di pubblico dominio.
RASMOL è capace di leggere numerosi formati di archivi di coordinate spaziali atomiche (pdb, xyz, mol, ecc.), posside una buona interfaccia grafica capace di rappresentare le molecole in varie modalità tridimensionali (wireframe, sticks, ball&stick, spacefill, ribbons, alpha -carbon trace, ecc.), consente un facile ed istintivo controllo della rappresentazione spaziale della molecola per mezzo del mouse ed infine dispone di una interfaccia di comando da tastiera, mediante la quale si possono creare sofisticate presentazioni molecolari.
Per sfruttare al meglio questa applicativo e per capirne le potenzialità è opportuno visitare la RASMOL Home Page.
L'effetto tridimensionale può essere apprezzato su monitor solo mettendo in movimento la molecola; per questo motivo, dopo aver scelto una modalità di visualizzazione, è fondamentale ruotare lentamente la molecola, osservando attentamente i suoi componenti strutturali.
Lo schema seguente riassume i comandi di movimento ottenibili
con il mouse:
comando mouse |
operazione |
| click dx | menu di controllo |
| click sx | rotazione attorno agli assi x e y |
| SHIFT + click dx | rotazione attorno all’asse z |
| CTRL + click dx | traslazione lungo gli assi x e y |
| SHIFT + click sx | zoom in / zoom out |
Per installare RASMOL nel proprio PC creare innanzitutto
una cartella (es. Rasmol), quindi copiarvi i seguenti files:
RW32B2A.EXE
RASHELP.exe
Per lanciare RASMOL basta richiamare Risorse del Computer,
cartella RASMOL ed attivare con un doppio click RW32B2A.EXE.
Piccola libreria di molecole organiche
IDROCARBURI ( Alcani Alcheni Alchini Aromatici )